团队名称：热带作物比较基因组与系统生物学Comparative Genomics and Systems Biology for Tropical Crops

团队研究方向：

（1）针对热带作物适应高光、高温多雨及间隙性干旱环境，获得高生物积累及其多样化代谢产物的特性，以木薯为模式，采用多组学、基因编辑、蛋白互作等技术，解析C3-C4光合作用，糖运输到块根淀粉积累效率的遗传变异，及其适应环境的信号调控机理。挖掘关键基因资源，运用于高产、抗逆、及多元化品质新品种创制。

（2）采用基因组和群体多组学分析技术，开展热带特色水果莲雾等风味和营养品质及其代谢途径解析，挖掘关键基因，建立分子育种基础。

（3）开发基因组学工具，开展热带生态位重要植物基因组测序和系统演化分析，创建基因组数据库和分子育种服务平台。

团队负责人：

王文泉，海南大学杰出人才特聘教授，二级研究员，博士生导师，康奈尔大学高级研究学者；国家重点研发计划基础前沿项目首席科学家，长期从事热带作物基因组学与遗传育种研究工作。先后主持973项目课题、国家自然科学基金-CG联合基金重点（2项）、科技部国际合作重点专项（2项）等国家级项目20余项。获得国家级和省部级科技奖励4项，国内、国际专利5项，培育作物新品种4个，在Nature Communications, Nucleic Acids Research等期刊发表论文200余篇，主编《热带作物种质资源学》等专著5部，培养博士、硕士研究生110余名。

团队成员：曾长英，司成成，郭鑫，杨志娟，李志栋，KHAN WASI ULLAH  鲍茹雪，（陈飞，王淑娟）。

团队专业网页链接：（https://bioinformatics.hainanu.edu.cn/ ）

团队研究成果：

1.代表性论文

（1）Pan-genome and Haplotype Map of Cultivars and Their Wild Ancestors Provides Insights into Adaptive Evolution of Cassava (Manihot esculenta Crantz)，bioRxiv, 2023 （MP under review）

（2）Cassava genome from a wild ancestor to cultivated varieties, Nat Commun. 2014 October 10; 5: 5110. doi: 10.1038/ncomms 6110

（3）MeGT2.6 increases cellulose synthesis and active gibberellin content to promote cell enlargement in cassava. Plant J 2024, 1-16. doi: 10.1111/tpj.16813

(4) Protein kinase MeSnRK2.3 positively regulates starch biosynthesis by interacting with the transcription factor MebHLH68 in cassava. J Exp Bot. 2024 doi: 10.1093/jxb/erae343.

(5) MePHD1.2 affects the synthesis of cyanogenic glycosides by regulating the transcription of MeCYP79D2 in cassava，Crop J 2024.

(6) Autotetraploid potato genome provides insight into highly heterozygous species，Plant  biotechnology J  2022, 20(10):1996-2005.

(7) Diploid wax apple (Syzygium samarangense) genome identified NAC genes regulating fruit development. Hortic Res. 2024 Jan 17, 11(3):uhae025.

(8) TCOD: an integrated resource for tropical crops. Nucleic Acids Res. 2023 Oct 16. doi: 10.1093/nar/gkad870.

(9) DataColor: unveiling biological data relationships through distinctive color mapping, Horticulture Research, 2024 11(2):1-11.

(10) HortDB V1.0: a genomic database of horticultural plants, Horticulture Research, 2024 12(10):1-3.

2.团队核心技术与品种：

建成拥有1600万元计算生物学设备的基因组和生物信息学平台，掌握最先进的第三代基因组测序、组装及注释技术（PAC-Bio，BioNano 和Nanopore），完成木薯野生和栽培品种4个基因组完全图谱；完成高生物量热带牧草美洲狼尾草、特色热带水果西番莲、同源四倍体马铃薯、澳洲坚果、无花果、芭蕉芋、野生荔枝、热带睡莲等20余个特色热带作物的全基因组精细图；收集木薯、西番莲、莲雾、睡莲等热带作物种质资源1000余份，创建了木薯、橡胶树、甘蔗、芒果和菠萝5个重要热带作物的基因组数据库(TCOD:https://ngdc.cncb.ac.cn/tcod/home )。

  3.木薯GS育种及新品种培育

培育木薯国审新品种SC16号和SC22号两个；通过杂交实验群体创建（1100个株系），国际合作种质共享（600余个品系）；总计获得300个以上显著性标记位点以及关联基因。通过亲本筛选、地理远缘杂交和后代适应性试验，培育出46-14、39-2、56-7、SM No.3、V4-8等50余个新品系，在株型、块根淀粉品质、抗PPD和产量等重要性状改良取得新进展。

  4.代表性专利：

“芝麻杂交制种技术”，2000年获得国家技术发明专利，专利证号：ZL94103410.0。

“基因组随机扩增序列SNP多态性及甲基化多态性的方法”,2015获得国家技术发明专利，专利号：ZL201410154134.9

获得科技奖励：

“芝麻基因雄性不育系MS86-1及杂交种豫芝9号”，1995年获得国家发明三等奖，第三发明人。

“木薯比较基因组及光合产物高效积累机理”，2015年，海南省科技进步1等奖；

“木薯全基因组测序及育种基础”，2016-2017年，神农中华农业科技二等奖；

“海南岛热带雨林主要经济立木彩色图鉴”，2010年，海南省科技进步二等奖。

5.荣誉称号：

第5届全国农业专业学位研究生教育指导委员会委员（2021-2025）

中国热带作物学会遗传育种专业委员会副主任；

全国作物生理与分子生物学会理事；

Tropical Plants英文期刊创刊主编；

农业科学与工程前沿（FASE）英文期刊编委；

海南省“杰出人才”（2019），海南省优秀科技工作者（2020）；

团队风采：

联系方式：海南三亚崖州湾海南大学南繁研究院，热带农林学院

电话：13807665106

Email：wangwenquan@itbb.org.cn；994341@hainanu.edu.cn Website: cassava-genome.cn